Escrito e ilustrado por el dúo Golden Pe Done: Masugitsune & Kawazuku. Sigue una historia en la que Madoka también regresa al pasado con Homura.
Puella Magi Homura Tamura (2012)
Escrito e ilustrado por Afro. Sigue a una Homura alterna llamada "Homura Tamura" en situaciones extrañas.
Mitakihara Kindergarten Mahougumi (2012)
Escrito e ilustrado por linco. Sigue a una historia en la que todas son infantes en un jardín de niños excepto por Mami Tomoe, quien dirige la guardería junto a Kyubey.
Mitakihara Antimaterials (2012)
Escrito e ilustrado por Myama, muestra a Homura viviendo como compañera de habitación de Mami por un mal entendido.
The Veranda of Madoka (2013)
Escrito e ilustrado por PAPA. Sigue una historia donde todas las protagonistas de Madoka Magica viven juntas.
Sute Ma! (2013)
Escrito e ilustrado por Ishito Yamada. Comedia donde Homura y Kyoko son un gato y un perro respectivamente.
Pomu Magi (2013)
Escrito e ilustrado por Tsukumo. Comedia donde Homura tiene una forma chibi.
Mangas publicados después de la salida Rebellion[]
Manga
Welcome to Café Grief Seed! (2013)
Escrito e ilustrado por Kotori Hinata es un manga donde las protagonistas de Madoka Magica dirigen un café y las clientas son brujas. Salió el mismo día que Rebellion.
Puella Magi Madoka Magica the Movie: Rebellion (manga) (2013)
Manga sobre la película Rebellion. Ilustrado por Hanokage
Puella Magi Oriko Magica: Sadness Prayer (2013)
Cuarto Spinoff. Escrito e ilustrado por Kuroe Mura.
